(1)缺乏理论指导, 缺乏统一规划
        据查新, 目前我国还没有结合国内状况尤其是国内保护区管理水平的较为全面系统的研究成果问世, 从开发到管理, 普遍缺乏对“生态旅游”真正内涵的理解, 往往将生态旅游与传统旅游、自然旅游混为一谈。当前大多旅游地或者保护区开展的“生态旅游”不过是人云亦云, 未制定详细的旅游规划或虽制定了旅游规划但实施过程中并未很好执行, 盲目建设的状况严重。我国人与生物圈国家委员会的一份调查资料显示: 一些自然保护区违反有关管理条例, 在缓冲区、甚至核心区内开展旅游活动。

        (2)资金投入不足, 限制了保护区开展生态旅游事业
        自然保护区收入来源大部分是门票所得, 一部分是政府投入, 还有少部分其他收入, 比如接受捐赠、实习、科研等收入。我国自然保护区平均投资水平仅为0.5 美元/ 公顷, 远远低于12.5 美元/ 公顷的国际标准。保护区的管理经费不足, 不仅制约了保护区的建设和发展,而且使大多数保护区无法发挥多种功能。

        (3)游客严重超载, 超出保护区的生态承载能力
        大多数旅游地往往是贪大求快, 实行经济目标第一的政策, 什么“去年游客200 万, 明年300 万, 若干年后突破500 万”而不是真正科学地基于生态承载量制定经济目标和限制游客数量, 没有一个游客容量的上限。游客大量涌入造成对保护区的过量践踏, 排放的生活垃圾及污染物剧增, 改变并侵蚀保护区的原貌。像张家界、九寨沟等地每逢节假日, 往往“游人如织, 人满为患”。这不但超出旅游地的接待能力, 影响旅游质量, 而且对脆弱的生态环境造成致命的摧残。

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